Op 21-jarige leeftijd maakt Lara deel uit van een belangrijke expeditie, maar het schip waarop ze zich bevindt komt in een verschrikkelijke storm terecht. Als een van de weinige overlevenden spoelt ze aan op een onbekend, maar niet onbewoond eiland. Volledig op zichzelf aangewezen moet ze haar grenzen leren kennen, om die daarna onder drukkende omstandigheden te verleggen.

De game omvat een meer dynamische en open wereld dan zijn voorgangers. Lara moet basiskampen aanleggen en langzaamaan haar omgeving verkennen om te overleven. Zo ontwikkelt ze de vaardigheden die haar later van pas komen.