Zoals verwacht zal de Wii U beackwards compatible zijn met de Wii. Gamecube spellen zullen echter niet geaccepteerd worden.
Welk formaat de Wii U gebruikt is nog in nevelen gehuld maar Nintendo heeft al gezegd dat het zeker geen Blu-Ray betreft. Verder zal de Wii U wederom geen harde schijf hebben maar het met flashgeheugen moeten stellen dat kan worden uitgebreidt met SD-kaarten en USB-opslagmedia.